太子參病蟲害的防治應堅持“預防為主、綜合防治”的原則，藥劑防治時，應優先選用生物農藥，其次選用化學農藥，化學防治時應有限制地使用高效、低毒、低殘留的農藥，應嚴格控制噴施濃度、畝用量、施用次數，在太子參采收前一個月內嚴禁使用任何農藥。
太子參病毒病
【危害特征】病毒病是太子參最主要、最重要的病害，受害植株葉片皺縮和花葉，植株早枯，塊根細而小，此病在產區發生普遍，發病率高達70％，嚴重危害和影響太子參的產量和質量。
【防治方法】①選用抗病品種。②最好用種子種植，其花葉病發生很少，且產量高。種子經0℃的低溫處理50天左右后播種，可培育出不帶毒的實生苗。③要建立無病毒采種田，以供大面積生產用種。自繁自育自己留種的，留種田在生長季節一定要隨時發現隨時拔除花葉病株，減少傳染。及時治蟲防病，確保種苗不帶毒。發現病毒病后，可選用病毒必克、病毒a等藥劑防治。
【注意事項】太子參的主要病害是病毒病，發現后應及時拔除。五月份后，黑斑病和白粉病也有發生，應用50%的代森錳鋅500倍液和15%的三唑酮1000倍液防治。太子參喜潮濕地塊，干旱時必須馬上澆水，同時，陰澇天也必須及時排澇，否則，將造成爛根，影響產量。
太子參葉斑病
【危害特征】葉斑病多發于春夏多雨季節，病株葉面常出現圓形或不規則形的褐色病斑，發病嚴重時可導致葉片褐色枯死，造成參根變小，產量降低。
【防治方法】①清除病株殘葉，減少越冬菌源。②發病初期用寶麗安（多氧霉素）1000倍液噴霧防治，中后期可用70％的代森錳鋅800倍液進行防治，每次用藥時適當加入葉面肥、增產菌、旱地龍等，以增強抗病、抗旱能力，提高產量。
