過磷酸鈣施人土壤中會發生化學變化，最突出的變化是磷的固定。在南方酸性土壤上易產生磷酸鐵、磷酸鋁沉淀，而在北方石灰性土壤上則形成磷酸鈣沉淀，從而降低了磷肥的有效性，使肥效大大降低，這就是磷肥當季利用率不高的主要原因。此外，磷肥在土壤中移動性小，移動距離一般為1～3厘米，而絕大部分集中在施肥點周圍0.5厘米范圍內。因此，提高磷肥利用率的原則是，既要減少肥料與土壤的接觸避免固定，又要增加肥料與根系的接觸，以利作物吸收。一般應采取以下措施：
(1)集中施用。過磷酸鈣無論是作基肥、種肥或是作追肥均應集中施用，以減少它與土壤的接觸。對中耕作物可采用條施或穴施的方法，水稻田可采用塞秧兜或蘸秧根的方法。通常作基肥的效果比追肥好。
(2)與有機肥料混合施用。與有機肥料混合施用可以減少肥料與土壤的接觸，因此也能減少水溶性磷酸一鈣的固定。實質上是利用有機肥料保護磷肥，減少固定。
(3)制成顆粒磷肥。制成顆粒磷肥也是減少磷肥與土壤的接觸面的一種做法，與集中施用有相同的意義。顆粒磷肥的粒徑一般以3-5毫米為宜。
(4)分層施用。在磷肥用量較多的情況下，可將用量的70%作基肥，其余30%作種肥，以保證苗期和中后期有充足的磷供作物吸收。
(5)根外追肥。根外追肥是經濟有效施用磷肥的方法之一。它可以完全避免土壤對水溶性磷酸一鈣的固定。尤其是在作物生長的后期，根系吸收養分能力減弱時，葉面噴施磷肥能夠增加水稻、小麥的千粒重，棉花的百鈴重和提高果樹的坐果率。噴施過磷酸鈣時，應先在磷肥中加入少量水配制成母液，放置澄清，取上層清液稀釋到所需濃度后噴施。噴施濃度應根據作物種類和生長狀況而定。一般雙子葉作物適宜的濃度為0.5%-1%，單子葉作物適宜的濃度為1%-2%。
