曲霉菌廣泛存在于自然界，常污染墊草和飼料，其孢子可隨空氣傳播。健康鴨通過吸入含有霉菌孢子的空氣或采食染菌飼料而經呼吸道或消化道感染，另外在種蛋孵化過程中，霉菌還可穿透蛋殼而使初生鴨感染。因此，要防止曲霉菌病的發生，應注意以下幾點：
⑴加強飼養管理。此病目前還沒特效治療辦法，重在預防，特別要注意鴨舍的通風和防潮濕。
⑵搞好環境衛生，及時清理鴨糞，更換墊料，不墊發霉的墊料。
⑶加強飼料貯存和保管工作，不喂已霉變的飼料。
⑷鴨舍、飼槽、飲水器等器具要定期消毒。
⑸喂料時要少喂勤添，避免料槽中飼料積壓。
⑹如果鴨群已被污染發病，病鴨要及時隔離，清除墊料和更換飼料，鴨舍要徹底消毒。
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