鴨病害肉尸處理應依據GB16548的有關規定進行。其主要內容包括：
(1)對各類含有鴨的畜禽飼養場、肉類聯合加工廠、定點屠宰點和畜禽運輸及肉類市場等，涉及鴨患傳染性疾病、寄生蟲病和中毒性病的肉尸（除去羽、內臟和爪）及其產品（內臟、血液、骨、爪和羽毛）的銷毀、化制、高溫處理和化學處理等。
(2)需要銷毀處理的對象包括患肉毒梭菌中毒癥、鴨瘟、禽流感等傳染病和惡性腫瘤或兩個器官發生腫瘤的鴨整個尸體以及從患病鴨各部分割下來的病變部分和內臟。根據條件情況，進行焚燒、炭化或投入濕化機熬制工業用油。
(3)需要化制處理的對象包括病變嚴重、肌肉發生退行性變化的除上述傳染病以外的其他傳染病、中毒性疾病及自行死亡或不明原因死亡的畜禽整個尸體和內臟。利用干化機，將原料分類，分別投入化制，也可投入濕化機熬制工業用油。
(4)高溫處理適用對象為感染禽霍亂等傳染病的同群鴨以及懷疑被其污染的肉尸和內臟，一般采用高壓蒸煮法和一般煮沸法進行處理。
(5)患鴨瘟病死鴨的血液、內臟、羽毛等，可根據情況用漂白粉、過氧乙酸、石灰乳溶液等處理。
